| 农学院 | 校长办公室 |
| 工学院 | 发展规划与学科建设处 |
| 植物保护学院 | 人力资源部、人才工作领导小组办公室 |
| 资源与环境科学学院 | 教务处、国家级实验教学中心、教师发展与教学评价中心 |
| 园艺学院 | 学生工作处、党委学生工作部 |
| 动物科技学院 | 研究生院、党委研究生工作部 |
| 动物医学院 | 科学研究院 |
| 食品科技学院 | 人文社科处 |
| 经济管理学院 | 国际合作与交流处、港澳台办公室 |
| 公共管理学院 | 计财与国有资产处 |
| 理学院 | 审计处 |
| 人文与社会发展学院 | 采购与招投标中心 |
| 生命科学学院 | 社会合作处、新农村发展研究院办公室 |
| 人工智能学院 | 实验室与基地处 |
| 信息管理学院 | 基本建设处 |
| 外国语学院 | 保卫处、党委政保部、党委人武部 |
| 金融学院 | 信息化建设中心 |
| 草业学院 | 离退休工作处 |
| 马克思主义学院、政治学院 | 校友总会办公室（教育基金会办公室） |
| 体育部 | 新校区建设指挥部、江浦实验农场 |
| 党委办公室、党委统战部、机关党委 | 浦口校区管理委员会 |
| 党委组织部、党校 | 后勤保障部 |
| 党委宣传部、党委教师工作部 | 图书馆（文化遗产部） |
| 纪委办公室、监察处、党委巡察工作办公室 | 国际教育学院、密西根学院 |
| 工会 | 继续教育学院 |
| 团委、公共艺术教育中心 | 资产经营公司 |
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